תכונות בטיחות של ניוביום

ליסוד ניוביום אין שימושים ביולוגיים ידועים. אבקת ניוביום עלולה לגרות את העיניים והעור, ועלולה לגרום לשריפות; עם זאת, מתכת ניוביום בתפזורת אינה מושפעת לחלוטין מבחינה ביולוגית (היפואלרגנית), ולכן אינה מזיקה. ניוביום נמצא בדרך כלל בתכשיטים, וכמה שתלים רפואיים מכילים גם ניוביום.

תרכובות ניוביום מסוימות הן רעילות, אך לציבור הרחב קשה לבוא במגע עם חומרים אלו. ניובטים וניוביום כלוריד שניהם מסיסים במים, ומדענים ערכו ניסויים בחולדות כדי לבחון את ההשפעות של חשיפה לטווח קצר ולטווח ארוך לתרכובות אלו. בחולדות, המינון הקטלני (LD50) לזריקה בודדת של ניוביום פנטכלוריד או ניובאט הוא בין 10 ל-100 מ"ג/ק"ג. מתן אוראלי היה פחות רעיל, עם LD50 לחולדות של 940 מ"ג/ק"ג לאחר שבעה ימים.